旧端末の物理SIMカード情報をiPhone 14 Proに転送したら、勝手にeSIMになっていた

最初に電話番号を引き継ぐか?のような質問があり、はい、を選んだら物理simをさしていないのにも関わらずモバイル通信表記がrakutenになっていたし電話も繋がったのでeSIM化されたのか？！と不思議に思い検索からこの投稿に辿り着きました。自分にとってはeSIMになったとて問題はないので良いのですが全く新しい体験だったので驚きです。笑　となると、もうこの残った物理SIMは破棄して問題ないのでしょうか？

元のコメントを確認させていただきましたが、主語もありませんし、返信機能も使用されていないので、普通は記事の内容に対するコメントと判断しても不自然ではないでしょう。
というかあなた、元のコメントをされた方では別の方ですよね？
「『ミスリード』が誰に対して言われてることなのか」を客観的に判断できる根拠を指摘できないのであれば、無用な横槍を入れる筋合いもないと思うのですが。

沢山のSIMの中に1個だけSIIMがいるのは遊び心なのか単なる間違いなのか…。

ばかなの？

勝手にではないと思うので、ご自身の印象だとしてもミスリードですね。
UI的な問題があるのは理解なのでApple側に改善を求めるスタンスならわかるのですが、、、

下の方のコメントの人は分かりませんが、私の場合は確認画面が出てきて普通にキャンセルできましたよ。

ちなみにオンラインでのeSIM切り替えは無料だから、その範疇なのでは？

魔法でも何でもなく単に物理SIMからeSIMへの変更をAppleがユーザーに変わってキャリアに申請してるだけ。普通にキャリアが旧SIMの無効化と新SIMの発行をしてるだけだけど費用は誰が負担してんだろ？　楽天は誰でも無料だから良いけどユーザーに発行費用を負担させてるキャリアの場合はiphoneユーザーだけ無料かよって思うわ、、、

たぶん私が使用している回線はサポートしてないと思うので試しませんでしたが、eSIM化したらそれ以降はSIMカードの方は無効になると考えれば良いのでしょうか？

私も12Proから14Proの移行でUQモバイルのSIMがeSIMに変換されてしまい混乱しましたが、元々eSIMに切り替えたいと思っていたところなので、特にデメリットはありませんでした。
仰られるように物理SIM差し替え派の人はeSIM化されると困りますので、説明・周知不足であったとして手数料なしで物理SIM再発行するなどの救済措置を取ってもらえると企業イメージ低下を防げるかと思いますがどうでしょうかね？
たった今、妻のXS Maxから12Proへ移行作業中ですが、ワイモバイルのSIMを差し替えるのが面倒に感じてしまいました。